Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS6KC1Q96S38 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms