Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD27Q96NW4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD27Q96NW4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD27Q96NW4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD27Q96NW4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD27Q96NW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD27Q96NW4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms