Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC42Q96M95 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC42Q96M95 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC42Q96M95 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC42Q96M95 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms