Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E2Q96LR5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms