Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX27Q96L92 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms