Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PRAC1Q96KF2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms