Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHAMP1Q96JM3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms