Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX27Q96GQ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX27Q96GQ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms