Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OPTNQ96CV9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPTNQ96CV9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms