Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKD2Q969F2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKD2Q969F2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms