Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA4DQ92854 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA4DQ92854 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms