Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIFAP3Q92845 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KIFAP3Q92845 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms