Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FRAT1Q92837 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FRAT1Q92837 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FRAT1Q92837 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms