Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUFY2Q8WXA3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY2Q8WXA3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms