Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRIM41Q8WV44 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms