Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX29Q8TEQ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms