Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL22A1Q8NFW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms