Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms