Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SV2AQ7L0J3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SV2AQ7L0J3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms