Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BLOC1S2Q6QNY1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BLOC1S2Q6QNY1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms