Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRNP1Q6NT89 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms