Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF18Q5VWM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF18Q5VWM3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms