Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF3Q5VWG9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms