Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms