Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms