Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF1Q3BBV0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NBPF1Q3BBV0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms