Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDRF1Q3B7T1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms