Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC85BQ15834 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
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