Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNX3Q13761 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNX3Q13761 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNX3Q13761 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNX3Q13761 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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