Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms