Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB3BPQ13352 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB3BPQ13352 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
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