Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SREBF2Q12772 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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