Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 SLD5YDR489W 885 nt3.18□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YGR160WYGR160W 612 nt3.18□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.18□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YKR011CYKR011C 1062 nt3.18□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YCL002CYCL002C 792 nt3.18□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 TIF4631YGR162W 2859 nt3.18□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 NMD2YHR077C 3270 nt3.18□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YBR259WYBR259W 2067 nt3.18□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YCG1YDR325W 3108 nt3.17□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 SRD1YCR018C 666 nt3.17□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 RSM28YDR494W 1086 nt3.17□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 RPB9YGL070C 369 nt3.17□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 RNR2YJL026W 1200 nt3.17□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YJL147CYJL147C 1149 nt3.17□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 PSK1YAL017W 4071 nt3.17□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 GYL1YMR192W 2163 nt3.17□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 FRE8YLR047C 2061 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 HFM1YGL251C 3564 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YDR061WYDR061W 1620 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 VPS3YDR495C 3036 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 CPR5YDR304C 678 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 QCR10YHR001W-A 234 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YNL013CYNL013C 378 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 RHO5YNL180C 996 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 GRE2YOL151W 1029 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 SHG1YBR258C 429 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 EPL1YFL024C 2499 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YHR080CYHR080C 4038 nt3.16□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.15□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 TAO3YIL129C 7131 nt3.15□□□□□ -1.9
AVL9Q12500 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YFR054CYFR054C 579 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 DSE2YHR143W 978 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 AIM18YHR198C 966 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YNL089CYNL089C 477 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YNR025CYNR025C 360 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 ADF1YCL058W-A 342 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 TOM70YNL121C 1854 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 REF2YDR195W 1602 nt3.15□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 UBC5YDR059C 447 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 HLR1YDR528W 1272 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 RSM18YER050C 417 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 AIM19YIL087C 474 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YKL123WYKL123W 381 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 ERG29YMR134W 714 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 DYN3YMR299C 939 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YNL109WYNL109W 546 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YOR277CYOR277C 309 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 snR42snR42 351 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 JJJ1YNL227C 1773 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 DOA4YDR069C 2781 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 BRE5YNR051C 1548 nt3.14□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 MNT3YIL014W 1893 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 NOP12YOL041C 1380 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 RPN1YHR027C 2982 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 ANR2YKL047W 1551 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 POL3YDL102W 3294 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YCR013CYCR013C 648 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YDR090CYDR090C 933 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 EMI1YDR512C 564 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 MVB12YGR206W 306 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YLL044WYLL044W 447 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YCL007CYCL007C 393 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 BNI4YNL233W 2679 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 MAK5YBR142W 2322 nt3.13□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YDL180WYDL180W 1644 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 SNQ2YDR011W 4506 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 SLK19YOR195W 2466 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 DUF1YOL087C 3351 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 VEL1YGL258W 621 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 ARC18YLR370C 537 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 SSN8YNL025C 972 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 SUS1YBR111W-A 291 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 NSA1YGL111W 1392 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 RCY1YJL204C 2523 nt3.12□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 SPO71YDR104C 3738 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 RSM24YDR175C 960 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 NSA2YER126C 786 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YGL082WYGL082W 1146 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 THG1YGR024C 714 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YGR107WYGR107W 450 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YJL169WYJL169W 369 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 SDS22YKL193C 1017 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 RPC37YKR025W 849 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 MRPL16YBL038W 699 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 ATX1YNL259C 222 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 AIM4YBR194W 372 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 STT4YLR305C 5703 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 SPP382YLR424W 2127 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 LST4YKL176C 2487 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 CWH41YGL027C 2502 nt3.11□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YDR262WYDR262W 819 nt3.1□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 MND1YGL183C 660 nt3.1□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YGR226CYGR226C 210 nt3.1□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 EFG1YGR271C-A 702 nt3.1□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.1□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 YLR076CYLR076C 423 nt3.1□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 REC102YLR329W 795 nt3.1□□□□□ -1.91
AVL9Q12500 HEH2YDR458C 1992 nt3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.9 ms