Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeastyeast

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OCA6Q12454 YML094C-AYML094C-A 402 nt1.84□□□□□ -2.11
OCA6Q12454 SLM4YBR077C 489 nt1.84□□□□□ -2.11
OCA6Q12454 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt1.84□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 FBP26YJL155C 1359 nt1.84□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 ROY1YMR258C 1662 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 CST9YLR394W 1449 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 FAB1YFR019W 6837 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 PEX8YGR077C 1770 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 SPC42YKL042W 1092 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YKL131WYKL131W 522 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 SRL3YKR091W 741 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 CWC24YLR323C 780 nt1.83□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 ANR2YKL047W 1551 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 GRX3YDR098C 858 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YOR062CYOR062C 807 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 FYV12YOR183W 390 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 RPC40YPR110C 1008 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 RRG8YPR116W 834 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YBR096WYBR096W 693 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 RED1YLR263W 2484 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 IRC10YOL015W 1761 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 SDC25YLL016W 3147 nt1.82□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 ECM5YMR176W 4236 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 ENP2YGR145W 2124 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 SNU23YDL098C 585 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YGL024WYGL024W 336 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YGL117WYGL117W 798 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 IKI1YHR187W 930 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YJL028WYJL028W 336 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 snR11snR11 258 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YNL018CYNL018C 1839 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 STD1YOR047C 1335 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 SNU114YKL173W 3027 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 PIN4YBL051C 2007 nt1.81□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 VPS34YLR240W 2628 nt1.8□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YCL076WYCL076W 744 nt1.8□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 MRPL25YGR076C 474 nt1.8□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 MET14YKL001C 609 nt1.8□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 CSE4YKL049C 690 nt1.8□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 BOS1YLR078C 735 nt1.8□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 TPT1YOL102C 693 nt1.8□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YDL050CYDL050C 372 nt1.79□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YHR210CYHR210C 1026 nt1.79□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YLR255CYLR255C 354 nt1.79□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt1.79□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YML090WYML090W 387 nt1.79□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.79□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 SME1YOR159C 285 nt1.79□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 PST1YDR055W 1335 nt1.79□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 MPH1YIR002C 2982 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 PEX5YDR244W 1839 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YGR026WYGR026W 837 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 ERV1YGR029W 570 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 UTP30YKR060W 825 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 CPR3YML078W 549 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 IRC21YMR073C 606 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 YSA1YBR111C 696 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 SHE3YBR130C 1278 nt1.78□□□□□ -2.12
OCA6Q12454 EMI1YDR512C 564 nt1.77□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 PRE4YFR050C 801 nt1.77□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.77□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 LIP2YLR239C 987 nt1.77□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 ALG5YPL227C 1005 nt1.77□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 UBR1YGR184C 5853 nt1.77□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 UTP6YDR449C 1323 nt1.76□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YCR007CYCR007C 720 nt1.76□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 RAV2YDR202C 1056 nt1.76□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YUH1YJR099W 711 nt1.76□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.76□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt1.76□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 STI1YOR027W 1770 nt1.76□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 SEC59YMR013C 1560 nt1.76□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 RGL1YPL066W 1440 nt1.75□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 SSF2YDR312W 1362 nt1.75□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 IZH1YDR492W 951 nt1.75□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.75□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YGR050CYGR050C 357 nt1.75□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 RSA3YLR221C 663 nt1.75□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 PDR17YNL264C 1053 nt1.75□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YAP7YOL028C 738 nt1.75□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 GIP3YPL137C 3831 nt1.74□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 PCL9YDL179W 915 nt1.74□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 RRP1YDR087C 837 nt1.74□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 CPR5YDR304C 678 nt1.74□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 MIG2YGL209W 1149 nt1.74□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 EBP2YKL172W 1284 nt1.74□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YOR263CYOR263C 408 nt1.74□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 MUS81YDR386W 1899 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 CFT1YDR301W 4074 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 ARF1YDL192W 546 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 HMO1YDR174W 741 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 NCB2YDR397C 441 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YMR320WYMR320W 306 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 IGO1YNL157W 507 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 ATG34YOL083W 1239 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 NCS2YNL119W 1482 nt1.73□□□□□ -2.13
OCA6Q12454 YMR1YJR110W 2067 nt1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms