Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 YAE1YJR067C 426 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-LR1Q12088 SCP1YOR367W 603 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-LR1Q12088 ART10YLR392C 1557 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-LR1Q12088 YLR422WYLR422W 5799 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-LR1Q12088 ALB1YJL122W 528 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-LR1Q12088 RGA2YDR379W 3030 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-LR1Q12088 USO1YDL058W 5373 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-LR1Q12088 ATG32YIL146C 1590 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-LR1Q12088 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.03□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.03□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 EAF5YEL018W 840 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 OSW5YMR148W 447 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 DOP1YDR141C 5097 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 IBA57YJR122W 1494 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 AGE1YDR524C 1449 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 ERP3YDL018C 678 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 MRP10YDL045W-A 288 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 HRI1YLR301W 735 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 HPA3YEL066W 540 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 RPB11YOL005C 363 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 PEX5YDR244W 1839 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 CTK2YJL006C 972 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 ERG29YMR134W 714 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 HOS4YIL112W 3252 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 RIC1YLR039C 3171 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YGR111WYGR111W 1203 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 SNL1YIL016W 480 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 COS3YML132W 1140 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 ISF1YMR081C 1017 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 COS2YBR302C 1140 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 SEC3YER008C 4011 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 VPS54YDR027C 2670 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 UBX3YDL091C 1368 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 SYH1YPL105C 2550 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YBL073WYBL073W 312 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YDL199CYDL199C 2064 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 LHS1YKL073W 2646 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 EPO1YMR124W 2832 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YPR097WYPR097W 3222 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 KXD1YGL079W 657 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 MTR2YKL186C 555 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 TAF14YPL129W 735 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 COG2YGR120C 789 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YIR014WYIR014W 729 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 CNS1YBR155W 1158 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 VPS3YDR495C 3036 nt1.96□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.96□□□□□ -2.09
TY1B-LR1Q12088 TPO5YKL174C 1857 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 RPS18AYDR450W 441 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 RPL20AYMR242C 519 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 YOR289WYOR289W 756 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 PLC1YPL268W 2610 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 MIG1YGL035C 1515 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 CCM1YGR150C 2595 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 RRP14YKL082C 1305 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 INA22YIR024C 651 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 CSE4YKL049C 690 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 ARR2YPR200C 393 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 SHE9YDR393W 1371 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 AGC1YPR021C 2709 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 SLM1YIL105C 2061 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 SPC98YNL126W 2541 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 SRD1YCR018C 666 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 TSR4YOL022C 1227 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 MPD2YOL088C 834 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 MDM32YOR147W 1869 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 UTP5YDR398W 1932 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 REV1YOR346W 2958 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 POL5YEL055C 3069 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 SEN15YMR059W 387 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 MLP2YIL149C 5040 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 TOM70YNL121C 1854 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 FMP48YGR052W 1110 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 NPL4YBR170C 1743 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 ERP1YAR002C-A 660 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 UFD2YDL190C 2886 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-LR1Q12088 SMP3YOR149C 1551 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 DAS2YDR020C 699 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 GRX3YDR098C 858 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 SNO3YFL060C 669 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 YLR224WYLR224W 1110 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 SNO2YNL334C 669 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 INA17YPL099C 549 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 snR3snR3 194 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 VPS38YLR360W 1320 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 PET100YDR079W 336 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 CTH1YDR151C 978 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 CRS5YOR031W 210 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 CYC2YOR037W 1101 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 MBA1YBR185C 837 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 MMS22YLR320W 4365 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 MCM21YDR318W 1107 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1B-LR1Q12088 HAL1YPR005C 885 nt1.88□□□□□ -2.11
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