Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 KHA1YJL094C 2622 nt3.38□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 XRN1YGL173C 4587 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YDR262WYDR262W 819 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 EMI1YDR512C 564 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 USE1YGL098W 738 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 SAE2YGL175C 1038 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 MVB12YGR206W 306 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 SDP1YIL113W 630 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YJL169WYJL169W 369 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YNL109WYNL109W 546 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 ATX1YNL259C 222 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 MRPL40YPL173W 894 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 FAS1YKL182W 6156 nt3.37□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 UBP8YMR223W 1416 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 URB2YJR041C 3525 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 DAD1YDR016C 285 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 RPS8BYER102W 603 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 PPX1YHR201C 1194 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YET1YKL065C 621 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 ILV5YLR355C 1188 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 RPS8AYBL072C 603 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 EAP1YKL204W 1899 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 STP2YHR006W 1626 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YDR193WYDR193W 399 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 RPB9YGL070C 369 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 PCL5YHR071W 690 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YIL082WYIL082W 873 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 RPL17AYKL180W 555 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 ECM4YKR076W 1113 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 REC102YLR329W 795 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 TIR2YOR010C 756 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 AFT2YPL202C 1251 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 SEC66YBR171W 621 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YLR446WYLR446W 1302 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 URA2YJL130C 6645 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 RAD2YGR258C 3096 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 ASI3YNL008C 2031 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 TAF1YGR274C 3201 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 CDC26YFR036W 375 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 DLS1YJL065C 504 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 RPL17BYJL177W 555 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 AIM25YJR100C 984 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 RPC37YKR025W 849 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM8Q12009 STI1YOR027W 1770 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YNR063WYNR063W 1824 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 BNI4YNL233W 2679 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 TGL3YMR313C 1929 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YDR338CYDR338C 2088 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 OCA6YDR067C 675 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 RSM24YDR175C 960 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 TMA20YER007C-A 546 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 MIC19YFR011C 513 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 VMA21YGR105W 234 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SFT1YKL006C-A 294 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YLR076CYLR076C 423 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 ARC18YLR370C 537 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 CSM4YPL200W 471 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 AKR1YDR264C 2295 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 CBP2YHL038C 1893 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 LCB4YOR171C 1875 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SPA2YLL021W 4401 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 ENA5YDR038C 3276 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YDL242WYDL242W 354 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YIP5YGL161C 933 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 RPL11BYGR085C 525 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 ANB1YJR047C 474 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YAP7YOL028C 738 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 RPL11AYPR102C 525 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 CUR1YPR158W 759 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SHQ1YIL104C 1524 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SHS1YDL225W 1656 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 JJJ2YJL162C 1752 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SRB4YER022W 2064 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 RPA135YPR010C 3612 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SMC2YFR031C 3513 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 MAK21YDR060W 3078 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 UBX3YDL091C 1368 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 MFB1YDR219C 1398 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 NOP12YOL041C 1380 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 LST7YGR057C 729 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 EFG1YGR271C-A 702 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 OST6YML019W 999 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 ADI1YMR009W 540 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YBL065WYBL065W 345 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YJL132WYJL132W 2253 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 MSR1YHR091C 1932 nt3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms