Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 ATG10YLL042C 504 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 RPL13BYMR142C 600 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 RSM19YNR037C 276 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YIL169CYIL169C 2988 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YNL011CYNL011C 1335 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 REG1YDR028C 3045 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 VAB2YEL005C 849 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 ATG27YJL178C 816 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YLR217WYLR217W 324 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 RPS7AYOR096W 573 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 PEX27YOR193W 1131 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 ERG11YHR007C 1593 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 ATG13YPR185W 2217 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 ARP5YNL059C 2268 nt3.36□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 PMR1YGL167C 2853 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YMR018WYMR018W 1545 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 URK1YNR012W 1506 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 NEW1YPL226W 3591 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 PEX10YDR265W 1014 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YFL015CYFL015C 495 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 GET1YGL020C 708 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 SUB1YMR039C 879 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 GCY1YOR120W 939 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YPL107WYPL107W 747 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 snR24snR24 89 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 snR35snR35 204 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YAK1YJL141C 2424 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 MSB2YGR014W 3921 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 HFM1YGL251C 3564 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 MSH2YOL090W 2895 nt3.35□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 RMD6YEL072W 696 nt3.34□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 MUS81YDR386W 1899 nt3.34□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 SRC1YML034W 2505 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 VPS41YDR080W 2979 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YGR115CYGR115C 780 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 VMA10YHR039C-A 345 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 SDH3YKL141W 597 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 SEC14YMR079W 915 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 RXT2YBR095C 1293 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 AVT5YBL089W 1380 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 CDC37YDR168W 1521 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 NOP56YLR197W 1515 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 VAC14YLR386W 2643 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YHR078WYHR078W 1659 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 PEX5YDR244W 1839 nt3.33□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YBR259WYBR259W 2067 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 GYL1YMR192W 2163 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 MYO5YMR109W 3660 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 GPM2YDL021W 936 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 RTT105YER104W 627 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YHR212CYHR212C 336 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YAR060CYAR060C 336 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 PFY1YOR122C 381 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 RAD18YCR066W 1464 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YCG1YDR325W 3108 nt3.32□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt3.31□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.31□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YGR126WYGR126W 693 nt3.31□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YIL141WYIL141W 390 nt3.31□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 MRP8YKL142W 660 nt3.31□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YKR011CYKR011C 1062 nt3.31□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 POP7YBR167C 423 nt3.31□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 ESL1YIL151C 3357 nt3.31□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 MUB1YMR100W 1863 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 MAK5YBR142W 2322 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 SLU7YDR088C 1149 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YEA4YEL004W 1029 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 SDP1YIL113W 630 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 PHD1YKL043W 1101 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YKL069WYKL069W 543 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 RPL23AYBL087C 414 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 RRG7YOR305W 729 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YOR385WYOR385W 873 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 CBP6YBR120C 489 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 TIF4631YGR162W 2859 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 TFC4YGR047C 3078 nt3.3□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 MDV1YJL112W 2145 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 KAP95YLR347C 2586 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 VPS3YDR495C 3036 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 MNT3YIL014W 1893 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 CEP3YMR168C 1827 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YDL242WYDL242W 354 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 UBC13YDR092W 462 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 RRT13YER066W 558 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YGL109WYGL109W 324 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 TAD1YGL243W 1203 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 TPK3YKL166C 1197 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 NBP1YLR457C 960 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 MPD2YOL088C 834 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 RPL33AYPL143W 324 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 RPC40YPR110C 1008 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 PFK26YIL107C 2484 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 OSW7YFR039C 1533 nt3.29□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 YJL132WYJL132W 2253 nt3.28□□□□□ -1.88
CTI6Q08923 AYT1YLL063C 1425 nt3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.6 ms