Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCL9Q07325 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms