Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EXOSC9Q06265 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC9Q06265 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC9Q06265 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms