Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RELAQ04206 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RELAQ04206 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RELAQ04206 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RELAQ04206 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RELAQ04206 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms