Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDR2Q01850 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms