Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms