Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBX1P62877 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBX1P62877 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBX1P62877 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBX1P62877 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBX1P62877 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBX1P62877 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms