Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMO4P61968 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMO4P61968 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMO4P61968 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMO4P61968 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMO4P61968 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms