Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHB4P54760 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHB4P54760 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms