Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA2D1P54289 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA2D1P54289 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms