Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLK1P49759 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLK1P49759 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLK1P49759 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLK1P49759 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLK1P49759 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLK1P49759 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLK1P49759 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLK1P49759 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLK1P49759 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLK1P49759 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLK1P49759 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLK1P49759 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms