Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NCAPD3P42695 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NCAPD3P42695 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms