Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC2P35250 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC2P35250 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC2P35250 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC2P35250 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC2P35250 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFC2P35250 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC2P35250 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC2P35250 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC2P35250 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC2P35250 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFC2P35250 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms