Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	MUB1	YMR100W	1863 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	TRX3	YCR083W	384 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SMX2	YFL017W-A	234 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SEC53	YFL045C	765 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	PRM8	YGL053W	714 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	REC104	YHR157W	549 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YJL086C	YJL086C	369 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RPL13B	YMR142C	600 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RET3	YPL010W	570 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YPL278C	YPL278C	303 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	PEX5	YDR244W	1839 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	TOP1	YOL006C	2310 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SPC105	YGL093W	2754 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SET1	YHR119W	3243 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	BAR1	YIL015W	1764 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	FMN1	YDR236C	657 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YIR020C	YIR020C	303 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	ANB1	YJR047C	474 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	MRP8	YKL142W	660 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YLR224W	YLR224W	1110 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	PDR17	YNL264C	1053 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	CSI2	YOL007C	1026 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	PEP4	YPL154C	1218 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	PRP22	YER013W	3438 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	CPA2	YJR109C	3357 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SNU56	YDR240C	1479 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	HSP30	YCR021C	999 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	FAD1	YDL045C	921 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	API2	YDR525W	330 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RPS8B	YER102W	603 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	DYN3	YMR299C	939 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YJL132W	YJL132W	2253 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SSE2	YBR169C	2082 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	FAT1	YBR041W	2010 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	AIP1	YMR092C	1848 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SNA4	YDL123W	423 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SMT3	YDR510W	306 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	EMI1	YDR512C	564 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	CDC26	YFR036W	375 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	MRM2	YGL136C	963 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RPL9A	YGL147C	576 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	YGR039W	YGR039W	312 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RPS16A	YMR143W	432 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	HHF1	YBR009C	312 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	ADY4	YLR227C	1482 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	PHO81	YGR233C	3537 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	LYP1	YNL268W	1836 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	MSK1	YNL073W	1731 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	VPS74	YDR372C	1038 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	VEL1	YGL258W	621 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	DPH1	YIL103W	1278 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RPL16A	YIL133C	600 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	ARC18	YLR370C	537 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RPL16B	YNL069C	597 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	PRM3	YPL192C	402 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	RPB5	YBR154C	648 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SIP1	P32578	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	MRPL11	YDL202W	750 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	STE14	YDR410C	720 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	COX13	YGL191W	390 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	ASI2	YNL159C	870 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	UTP15	YMR093W	1542 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	ARG2	YJL071W	1725 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YNL193W	YNL193W	1677 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	HRD1	YOL013C	1656 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	RIM13	YMR154C	2184 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	FAR8	YMR029C	1572 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	RSM24	YDR175C	960 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	PEX10	YDR265W	1014 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	RPC37	YKR025W	849 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	ENV10	YLR065C	546 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YLR416C	YLR416C	399 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	IMP1	YMR150C	573 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	PEX11	YOL147C	711 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YOR331C	YOR331C	558 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	SCY1	YGL083W	2415 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	CCM1	YGR150C	2595 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	GSC2	YGR032W	5688 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YDR061W	YDR061W	1620 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	TIF4631	YGR162W	2859 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	GDS1	YOR355W	1569 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YDL032W	YDL032W	312 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	IRC2	YDR112W	309 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SIP1	P32578	YDR537C	YDR537C	606 nt		3.25	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.2 ms